Среди наиболее распространенных методов обезжелезивания воды сегодня принято называть реагентные методы, которые подразумевают обработку воды теми или иными химическими реагентами. Химические методы очистки в свою очередь делятся на два типа: те, которые используют для удаления железа окислители, и те, которые в своей основе имеют процесс коагуляции мелких частиц загрязнителя.

Методы, которые в своей основе имеют окисление растворенного железа, подразумевают введение в воду каких-либо окислителей. Наиболее распространенными эффективными окислителями сегодня считаются такие окислители как хлор и его производные, а также озон. Более безопасным из этих двух категорий окислителей считается озон, который в отличии от хлора оказывает минимальное воздействие на физико-химические свойства воды, в то время как хлор и его производные существенно изменяют состав и свойства воды. Это обуславливается высокой скоростью разложение озона при контакте с воздухом и водой — озон по завершении реакции разлагается на безопасные вещества вроде воздуха, кислорода и самой воды, в то время как не задействованный в реакции хлор остается в воде в своей изначальном виде, что оказывает негативное влияние как на органолептические качества воды, так и на ее общее качество. Среди преимуществ окислительных методов принято называть выполнения различных задач этими мерами: хлорирование и озонирование позволяют произвести не только очистку воды от железа, но также и ее обеззараживание, что позволяет совместить в одном блоке системы водоподготовки задачи двух фильтров.

Очистка воды от железа методом коагулирования подразумевает использование особого рода химических реагентов — коагулянтов, одним из свойств которых является способность склеивать между собой мелкие частицы загрязнителя. Таким образом основой коагуляции является укрупнение мелких частиц, что приводит к увеличению их массы и объема, в следствии чего становится возможных их устранение любыми механическими методами очистки. Так, например, коагулирование можно использовать в сочетании с механической фильтрацией сквозь слой зернистого или пористого материала, в ходе которой между гранулами или порами загрузки остаются частицы загрязнителя, в то время как очищенная вода беспрепятственно проходит через фильтрующий материал.

Выбор того или иного химического способа очистки воды от избытков растворенного железа напрямую зависит от формы железа, а также уровня содержания загрязнителя и процентного соотношения разных форм загрязнителя в воде: для удаление больших количеств растворенного железа применяются окислительные методы, а для удаления мелкодисперсного, но нерастворимого железа, применяется коагуляция.